Peranan kelelawar dalam ekosistem dan pada manusia ternyata sangat besar. 

Peran kelelawar ini selain menjamin keseimbangan ekosistem pun memberi manfaat penting pada manusia.

Sebagai hewan pemakan segalanya atau omnivora, kelelawar juga memiliki kegunaan sebagai pembasmi hama pertanian.

Kelelawar tak hanya makan buah-buahan, tetapi juga serangga. Salah satu hama yang dapat dibasmi dengan kelelawar adalah hama wereng.

Karena itulah hasil panen padi yang sawahnya berada di sekitar gua tempat tinggal kelelawar lebih baik dari daerah lain.

Tak hanya itu, Kelelawar juga dapat membantu penyerbukan serta penyebaran bibit.

Kelelawar seperti codot dan kalong, meskipun memakan buah dan sering dianggap sebagai hama diperkebunan tetapi sebenarnya mempunyai andil besar pada proses penyerbukan tumbuhan.

Ada lima puluh dua jenis pohon yang diuntungkan kelelawar untuk proses penyerbukan maupun penyebaran bibitnya, diantaranya yakni durian, mangga, rambutan duku serta pisang.

Tak hanya buah-buahan, beberapa tumbuhan penghasil kayu dan obat, juga bergantung pada kelelawar di dalam penyebaran bibitnya.